Ботаніко-географічна ділянка “Середня Азія” створена в 1953 році. На площі 3,5 га представлена рослинність альпійських та субальпійських лук, ялинкових лісів, арчевників, яблунево-глодових лісів, тугаїв, фісташників та пісків. Колекція складається із 102 видів рослин. Серед рідкісних та зникаючих видів є види внесені до Червоної книги Середньої Азії та Казахстану: цибуля пскемська (Allium pskemeuse), цибуля Суворова (A. suvorovii), абрикоса звичайна (Armeniaca vulgaris), кучерявка Мушкетова (Atraphaxis muschketivii), яблуня Нідзведського (Malus niedzwetzkyana), горобина туркестанська (Sorbus turkestanica), тюльпан Міхелі (Tulipa micheliana), тюльпан прегарний (T. praestans) та тюльпан пізній (T. tarda).

До таких видів варто додати також афлатунію вязолисту (Aflatunia ulmifolia), ясен річковий (Fraxinus potamophila), яблуню Сіверса (Malus sieversii) та фісташку справжню (Pistacia vera), які внесені до Червоної книги Казахстану.

Рідкісні види флори Середньої Азії – цибуля голуба (Allium caeruleum), цибуля Крістофа (A. christophii) та цибуля Суворова (A. suvorovii) утворили на ділянці гомеостатичні популяції.